直播回顾丨DNA编码化合物库的新型应用探索 发布时间：2023-10-09

9月21日，成都先导药物开发股份有限公司DEL研发总监高森受邀在火石数链药械课堂直播间进行《DNA编码化合物库的新型应用探索--让每一个医药研发新想法都有处安放》主题分享，与行业同仁及观众在线沟通交流。

不小心错过了直播没关系，总结提炼来啦！

一、DEL技术的应用

DNA编码化合物库(DNA-Encoded Library, DEL)技术作为强大的小分子药物发现引擎，可提供多样性的化合物合集（十亿至万亿级化合物）。DNA编码策略使得苗头化合物发现周期大大缩短，研发成本降低。DEL技术在小分子发现领域逐渐发展，截至目前，已有超过100个以上的全新结构的高吸引力的化学分子被发现。同时，靶点类型丰富，其中不仅包括传统的酶类蛋白，还包了具有挑战性的蛋白-蛋白相互作用及核酸类靶点等。

DEL筛选的靶点类型以及在不同靶点类型下报道的分子个数

近年来，DEL技术的应用范围逐渐被突破，除了在传统的基于纯化靶点的亲和力筛选应用之外，还可应用于靶点的功能性筛选，例如使用微流控技术辅助DEL生化功能筛选，或是用于细菌抗生素的筛选。随着技术的发展，DEL技术也可以助力细胞胞外或者胞内靶点进行筛选。作为新颖的高通量药物筛选技术，DEL技术在分子、DNA序列、筛选以及应用层面，都面临着不同的挑战。这并不仅仅是DEL技术本身的问题，也是DEL技术的生态问题，如何让DEL技术在不断发展与变化的药物研发需求中展现良好的适用性、基石性或衍生性，这或许也是未来的发展重点。

DEL技术的应用

二、成都先导的万亿级DNA编码化合物库

成都先导已构建超过1.2万亿的DNA编码分子化合物，其分子类型多样，包括传统的小分子化合物库、大环化合物库、分子片段化合库、共价化合物库、蛋白降解三联体化合物库等。同时，除了利用多样性的化合物库发现具有新颖结构的苗头化合物之外，成都先导也利用DEL技术的优势进行已知分子的优化。相较于传统的药物化学优化方法，DEL技术可以快速产生百万级的新颖化合物，并快速筛选产生活性更高、选择性更好或成药性更高的化合物。

成都先导不同类型的DNA编码化合物库

成都先导在DEL技术领域深耕多年。截至目前，公司已发表DEL相关文献28篇，并在2021年发布了全球首篇DEL行业白皮书，助力科研（《DNA编码化合物库平台赋能新药研发白皮书》）。

三、OpenDEL^®以完全开放的形式赋能小分子药物发现

2015年，成都先导首次正式推出了DEL自助筛选服务产品OpenDEL^®（HitGen – OpenDEL (nature.com)）。经过不断更新迭代，最新的OpenDEL^®包含了约30亿的独特结构分子，50个DNA编码化合物库。

OpenDEL^®是一款开放式的小分子筛选产品，其包含的分子结构信息、分子砌块信息、骨架结构信息、化合物编码信息，对于产品用户全披露，并为客户提供完整的筛选操作指南。而且，用户使用该产品无需为分子结构信息披露额外付费，也无需为IP产权额外付费。基于完全开放、信息全披露的特性，OpenDEL^®在药物发现领域，可实现高效便捷的靶点发现以及全新先导化合物的快速获取，在AI领域，其可提供海量的高质量筛选数据，高效助力人工智能算法开发和验证以及其他前沿探索（OpenDEL^® (hitgen.com）。

成都先导不仅提供OpenDEL^®产品，也可以根据客户需求提供上下游全流程服务，如筛选服务、测序服务、分子优化等，在保护客户项目IP的同时，助力客户各类药物发现需求的快速推进。

DEL全流程服务

四、OpenDEL^®案例分享

案例一：OpenDEL^®助力AI-ML实现分子预测

加州大学Mobley团队与Anagenex公司利用成都先导OpenDEL^®系列产品，基于soluble epoxide hydrolase(sEH), 结合人工智能（AI）与机器学习（ML）技术（DOI: 10.26434/chemrxiv-2023-pq197），成功建立了一套新型信息学预测系统，实现“信息-结构-功能”的预测。研究团队指出，随着数据量的增大，深度学习模型的训练与预测表现将会更好，甚至能进一步建立更为复杂的信息网络。（链接到上次微信稿-2023-05-31那一篇）。

案例二：OpenDEL^®对全新靶点的可成药性验证

不同靶点的信号富集

OpenDEL^®系列产品在全新靶点筛选中信号富集丰富，快速验证新颖靶点的可被小分子靶向的可行性。单个DEL的结构多样性往往是收敛的，结构相关性较高。利用OpenDEL®产品，其内含的50个具有独特设计的DEL，约30亿分子实体，DEL结构类型丰富多样，不同的库设计能较大程度满足不同类型的全新靶点的筛选尝试，能够为新靶点带来丰富且有效的起点分子。

案例三：OpenDEL^®助力目标靶点Hits快速发现

从获得OpenDEL^®产品到实验设计与筛选，经由信号解析与分析，再到分子合成与测试，可在1-3个月内高效完成想法的快速验证，并能获得具有良好活性与成药属性的分子。通过OpenDEL^®系列产品不仅可快速实现多系列nM级分子发现，并且可通过筛选数据进一步开展SAR/SSR信息挖掘，对后续分子优化提供丰富的信息指导。

自发布以来，OpenDEL^®产品已覆盖全球10余个国家，用户包括近百家生物医药企业、AI技术企业及学术机构和院校，客户二次回购率达60%。

自助式筛选服务产品OpenDEL^®——让药物发现更便捷！

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