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科技前沿 | 惰性化学键的活化:成都先导开发出适用于DEL合成的光催化脱氨碳-碳偶联反应 发布时间:2022-04-08


 

近日,成都先导药物开发股份有限公司在光催化碳-碳偶联领域取得重要突破,通过光催化的脱氨反应成功实现DNA上sp3-sp3杂化的碳-碳键的构建,并证明能够用于DNA编码化合物库(DNA-Encoded Library,DEL)的合成。该方法条件温和,底物适用性广,并且可以把常规DEL化学难以利用的大位阻胺利用起来,提供了更多的分子多样性。目前,该成果已发表于美国化学会的《有机化学通讯》(Organic Letters,10.1021/acs.orglett.2c00697)。1

 

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开发DNA兼容的碳-碳成键反应一直是DEL化学研究的一个热点领域。除了传统的钯催化偶联,最近几年不断有基于光催化的碳-碳偶联反应获得报道。这些反应大多通过对羧酸或者活性氢进行活化,产生自由基后通过自由基加成形成新的碳-碳单键(图一a,b)2-4 。2020年,Rovis课题组首次在小分子合成中实现用大位阻胺作为自由基供体进行C-C单键的构建(图一c)5。成都先导的科学家在Rovis课题组成果的基础上,对反应条件进行了进一步优化,成功把该反应引入了DEL合成中,并证明了该反应对DNA以及胺底物的兼容性(图一d)。

 

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图一:光催化C(sp3)-C(sp3)偶联反应发展简介

 

首先,团队以与DNA连接的烯烃1a与活性亚胺2a为模型底物,以Rovis报道的条件为出发点,通过对催化剂、反应添加剂等各种条件进行筛选,发现以Ir[dF(CF3)ppy]2(bpy)PF6作为光催化剂,K3PO4作为添加剂,在室温蓝光光照的情况,模型底物可以实现最高76%的转化率(图二)。而且,团队发现,利用预活化的方式,可以简化活性亚胺的合成,为该反应应用于高通量的DEL合成铺平了道路。

 

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图二:光催化脱氨碳碳偶联的条件优化
 

 

在完成条件优化之后,成都先导团队对底物适用范围进行了拓展,验证了不同大位阻脂肪胺的反应活性。从图三可以看出,在该反应条件下,不论是二级胺还是三级胺,大多能展现出良好的反应活性(3a-3l)。与此同时,该反应还展现出了良好的官能团耐受性,无论是Boc保护的胺基、羧酸还是芳卤都不会对反应效率产生太大的影响(3n-3x)。

 

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图三:光催化脱氨碳碳偶联的底物范围

 

与此同时,成都先导团队利用扩增实验证明了该反应不会造成显著的DNA损伤,通过对照实验验证了在DNA上的合成的分子结构的准确性。最后,通过模拟库的合成证明了该反应可以用于高通量的DEL合成(图四)。

 

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图四:模拟库合成实验结果

 

综上,该工作开发了一种高效的、底物适用范围广、DNA兼容的光催化脱氨碳-碳偶联合成方法,并证明了该方法对DEL合成适用性。

 

参考文献:

1)      Shen, Y.; Yang, G.; Huang, W.; Shaginian, A.; Lin, Q.; Wan, J.; Li, J.; Deng, Y.; Liu, G. Org. Lett. 2022, 10.1021/acs.orglett.2c00697.

2)      Kölmel, D. K.; Loach, R. P.; Knauber, T.; Flanagan, M. E. ChemMedChem 2018, 13, 2159−2165.

3)      Shan, J.; Ling, X.; Liu, J.; Wang, X.; Lu, X. Bio. Med. Chem. 2021, 42, 116234-116238.

4)      Wu, R.; Du, T.; Sun, W.; Shaginian, A.; Gao, S.; Li, J.; Wan, J.; Liu, G. Org. Lett. 2021, 23, 3486-3490.

5)      Ashley M. A.; Rovis T. J. Am. Chem. Soc. 2020, 142, 18310-18316.

6)       Dorsheimer J. R.; Ashley M. A.; Rovis T. J. Am. Chem. Soc. 2021, 143, 19294-19299.

 

 

关于成都先导DNA编码化合物库(DEL)技术平台

DNA编码化合物库(DEL)技术平台,是成都先导四大核心技术平台之一,提供DEL筛选、定制DEL库、OpenDEL®产品和服务,助力加速新药研发。成都先导的DEL库小分子种类已突破万亿,是全球目前已知的化合物最多、规模最大的实体小分子化合物库。

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